STIKes Sukabumi dipimpin oleh Ketua STIKes yang bertanggung jawab dan mengendalikan pencapaian VMTS dengan menetapkan Susunan Organisasi dan Tata Kelola (SOTK) yang ditetapkan dalam SK Ketua STIKes Nomor 91/HO.00.01/SDM-STIKESMI/V/2021 Tanggal 18 Mei 2021 Tentang Revisi Pedoman Susunan Organisasi Dan Tata Kelola (SOTK) Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Sukabumi.